Медицинское обслуживание населения обеспечивают 46 лечебно-профилактических учреждений, центральная районная больница и входящие в ее состав 6 врачебных амбулаторий, 39 фельдшерско-акушерских пунктов.
Амбулаторно-поликлиническая сеть представлена поликлиникой на 500 посещений в смену и 6 врачебными амбулаториями (Никифаровская, Аксеновская, Кызыльская, Слаковская, Шафрановская, Раевская) на 385 посещений в смену.В круглосуточном стационаре размещена 176 коек: терапевтические, неврологические, кардиологические, педиатрические, травматологические, хирургические, реанимационные, акушерско-гинекологические, инфекционные, психиатрические и паллиативные.
Круглосуточная медицинская помощь оказывается тремя бригадами скорой медицинской помощи. Радиус их обслуживания составляет 75 км. С января 2009 года организована неотложная медицинская помощь при поликлинике, помимо этого круглосуточная медицинская помощь оказывается при ЦРБ бригадой дежурных врачей (терапевт, хирург, реаниматолог, педиатр).
В целях рационального использования коечного фонда, повышения эффективности использования ресурсов здравоохранения мы применяем стационарозамещающие технологии, что позволило повысить качество оказания медицинской помощи, снизить уровень госпитализации в круглосуточные стационары, сократить расходы на лечение и время восстановления трудоспособности. С этой целью развернуты 83 койки дневных стационаров при амбулаторно-поликлинических учреждениях и стационаре по 4 профилям: терапия, гинекология, педиатрия, хирургия.
Квалифицированная специализированная медицинская помощь оказывается по 36 специальностям. Открыты новые кабинеты, которые оборудованы новейшими диагностическими аппаратами. Расширены лабораторная служба, физиотерапевтическое, рентгенологическое, стоматологическое отделения. Реанимационное отделение и отделение новорожденных оснащены современным медицинским оборудованием.
В системе здравоохранения района работают 669 человека, в том числе 84 врачей (48%) имеют первую и высшую квалификационную категорию), 339 средних медицинских работника (63% имеют квалификационные категории). В районе работают три кандидата медицинских наук, 6 врачей удостоены почетного звания «Заслуженный врач РБ», 1 награжден нагрудным знаком «Отличник здравоохранения СССР», 19 врачей и 15 средних медработника – знаком «Отличник здравоохранения РБ» . Награждены знаком «За самоотверженный труд в РБ» – 1 врач, медалью «За заслуги перед Отечеством» – 1 врач, медалью «За трудовую доблесть» – 2 врача.
С началом реализации программы «Земский доктор» на работу в Альшеевский район прибыли 36 молодых специалиста-врача. Из них на сегодняшний день работают – 24 врача, по программе «Земский фельдшер» - прибыло 5 фельдшеров, из них на сегодняшний день работают 4.
Разработана маршрутизация больных на основе сформированной трехуровневой системы оказания медицинской помощи, благодаря этому повысилась качество оказания медицинской помощи.
Согласно Распоряжению Правительства Республики Башкортостан от 30.04.2013 г. № 515-р «Об утверждении плана мероприятий («дорожной карты») «Изменения в отраслях социальной сферы, направленные на повышение эффективности здравоохранения в Республике Башкортостан», нами разработан План мероприятий «Дорожная карта» на 2013-2018 гг., направленный на повышение эффективности деятельности лечебных учреждений района и их работников. Реализация мероприятий, предусмотренных «дорожной картой», позволит обеспечить преемственность ведения больного на всех этапах, что значительно повысит качество медицинской помощи населению и позволит улучшить основные демографические показатели, увеличить укомплектованность врачебными кадрами, повысить среднюю заработную плату медицинским работникам.
Приоритетными направлениями развития здравоохранения района остаются: повышение доступности и качества оказания медицинской помощи населению, дальнейшее развитие диагностической службы, развитие стационарозамещающих технологий, усиление профилактической направленности в деятельности медицинских работников, формирование здорового образа жизни среди населения, расширение компьютерной сети и введение информационных программ, реализация Плана мероприятий «Дорожная карта» на 2013-2018 гг.