Медицинское обслуживание населения Кугарчинского района осуществляется центральной больницей, Юмагузинской сельской участковой больницей, пяти врачебными амбулаториями и 52 фельдшерско- акушерскими пунктами. Всего по району 111 круглосуточных коек , из них 20 коек паллиативной помощи.
Несмотря на принятые меры при высоких показателях рождаемости в 2014 году 16,4%, остаются высокими показатели смертности 16,7 %.Коэффициент естественного прироста населения остается отрицательным - 0,3. В последние пятнадцать лет не допущена материнская смертность. Несмотря на принятые меры выше среднереспубликанских показателей младенческая смертность и составляет - 10,3.
В последние годы, благодаря администрации района, укрепляется материально-техническая база лечебно-профилактических учреждений района, в 2014 году переведены в новые здания Янаульский, Мукачевский фельдшерско-акушерские пункты, в 2015 году построен фельдшерско- акушерский пункт в д.Тупчаново. Все медицинские учреждения укомплектованы современной медицинской аппаратурой.
Большое внимание уделяется по укомплектованию врачебными кадрами лечебно-профилактических учреждений района, после введения программы «Земский доктор» в район на работу прибыло 22 специалиста, что соответственно обеспечило доступность медицинской помощи в сельской местности.
В системе здравоохранения района трудятся 63 врача, 273 средних медицинских работников, из них имеют звание «Заслуженный врач Республики Башкортостан - 10, заслуженных медицинских работников - 7, отличников здравоохранения Республики Башкортостан - 52, более 10 человек награждены Почетными грамотами Министерства здравоохранения Российской Федерации.
Современную медицину невозможно представить без информационных технологий, телемедицины и компьютеризации.
Разработка и внедрение современных информационных систем в системе здравоохранения района является одной из перспективных задач. В целях обеспечения работы медицинского персонала каждое рабочее место обеспечено компьютерной техникой, все 7 медицинских учреждений района соединены в единую компьютерную сеть через Интернет, что позволяет вести работу в ON-Lайн режиме. Налажена работа по записи на прием к врачу через кол. центр, Инфомат и в порядке живой очереди в регистратурах, что соответственно привело к снижению очередности. Начата компьютеризация фельдшерско-акушерских пунктов. В 2006 году запущен в эксплуатацию пункт «Телемедицины», один из первых среди сельских районов. За период функционирования телемедицины проведена консультация пациентов специалистами Республиканских учреждений и крупными медицинскими центрами г.Москвы.
Ежегодно проводится дистанционное обучение врачей на циклах повышения квалификации без отрыва от производства. Ежемесячно проводятся семинары для врачей по актуальным вопросам в области медицины.
В стадии внедрения лаборатория информационной системы.
Руководством больницы налажена тесная связь со студентами Башкирского медицинского университета, ежегодно проводятся встречи с трудовыми коллективами. Студенты проходят практику на базе ГБУЗ РБ Мраковской ЦРБ.
Медицинские работники ведут активную пропаганду здорового образа жизни. Постоянно участвуют в спортивных соревнованиях, организованных в районе и Республике, наши коллеги завоевывают призовые места.
Достаточно большая работа проводится по оздоровлению своих сотрудников, ежегодно 5-6 сотрудников укрепляют свое здоровье на базе отдыха «Бодрость», все желающие круглогодично обеспечиваются детскими путевками в санатории и оздоровительный лагерь «Мурадым».